Generación de mapas con crear_mapa_simple()

Introducción

Esta vignette muestra distintos ejemplos de mapas generados con la función crear_mapa_simple() del paquete metagesToolkit.

# Función para la exploración y visualización de datos de colecciones y bases de datos.
mapa <- crear_mapa_simple()     # Genera una lista de R con 2 elementos

# Output
mapa$data_map                   # Muestra el data frame creado con los filtros aplicados
mapa$plot                       # Muestra el mapa creado con los filtros aplicados

El objetivo es ilustrar cómo se pueden visualizar colecciones biológicas y bases de datos de biodiversidad en España mediante distintos parámetros de la función, sin entrar en detalles de edición cartográfica avanzada.

Datos de ejemplo

Desplegar datos

Para los ejemplos se utilizan datos extraídos del Registro de colecciones mediante la función extraer_colecciones_mapa()$data.

Mapa básico por estado de publicación

En metagesToolkit existe otra función para crear mapas usando crear_mapa_entidades(), que muestra la distribución espacial de las entidades del Registro segun su estado de publicación en GBIF.

Mapa básico por numero de ejemplares

Ejemplo mínimo de uso de crear_mapa_simple(), mostrando la distribución espacial de todos los recursos del Registro.

Mapa colecciones zoológicas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Zoo"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones zoológicas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Zoo", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de invertebrados

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Invertebrados"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de invertebrados publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Invertebrados", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de vertebrados

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Vertebrados"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de vertebrados publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Vertebrados", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de invertebrados y vertebrados

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Invertebrados y vertebrados"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de invertebrados y vertebrados publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Invertebrados y vertebrados", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones botánicas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Bot"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones botánicas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Bot", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de plantas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Plant"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de plantas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Plant", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de algas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Algas"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de algas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Algas", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de hongos

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Hong"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de hongos publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Hong", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de botanicas mixtas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Botánicas mixtas"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones de botanicas mixtas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", subdisciplina = "Botánicas mixtas", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones microbiológicas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Micro"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones microbiológicas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Micro", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones paleontológicas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Pale"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones paleontológicas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Pale", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones mixtas

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Mix"), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa colecciones mixtas publicadoras

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "coleccion", disciplina = "Mix", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro.

Mapa facetado de bases de datos por disciplina (publicadoras)

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "base de datos", facet = "disciplina_def", publican = T), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro, facetada por disciplina.

Mapa facetado de bases de datos por disciplina (no publicadoras)

Ejemplo de uso de crear_mapa_simple(tipo_coleccion = "base de datos", facet = "disciplina_def", publican = F), mostrando la distribución espacial de los recursos del Registro, facetada por disciplina.

(Si no hay imagen es porque no hay datos para esta categoría)

Acceso a los datos usados en el mapa

La función crear_mapa_simple() devuelve una lista que incluye los datos filtrados utilizados para generar el mapa, lo que permite reutilizarlos en tablas o análisis posteriores.

res <- crear_mapa_simple(disciplina = "Zoo")
head(res$data)

Notas técnicas

• crear_mapa_simple() devuelve una lista con al menos:
  • plot: objeto ggplot2
  • data: datos filtrados utilizados en el mapa
• El mapa base de España se genera automáticamente y trata de forma específica el desplazamiento de Canarias.

Referencias

• Documentación de la función: ?crear_mapa_simple
• Sitio pkgdown del paquete metagesToolkit