Tabla resumen taxonomico de registros GBIF publicados por Espanha — extraer_resumen_taxonomico

Genera una tabla resumen con el numero de registros publicados en GBIF.es, desglosados por reino y acompanhados del numero de clases, ordenes, familias, generos y especies representadas en dichos registros.

Usage

extraer_resumen_taxonomico_gbif(basisOfRecord = NULL)

Arguments

basisOfRecord: Vector de tipos de registro a incluir. Si es NULL, no se aplica filtro por tipo de registro.

Value

Un tibble con las siguientes columnas:

Reino: Nombre del reino taxonomico.
NU+000BA registros: numero total de registros publicados.
NU+000BA clases: numero de clases representadas en los registros.
NU+000BA ordenes: numero de ordenes representadas.
NU+000BA familias: numero de familias representadas.
NU+000BA generos: numero de generos representados.
NU+000BA especies y taxones infraespecificos: numero de especies representadas en los registros.

Details

Los conteos taxonomicos se calculan utilizando facets del endpoint /occurrence/count, por lo que respetan los filtros de pais, estado de ocurrencia y basisOfRecord.

Se adiciona una fila final denominada Total con la suma de todas las metricas numericas.

Ejemplos habituales de valores para basisOfRecord:

Especimenes:


c("PRESERVED_SPECIMEN",
  "MATERIAL_SAMPLE",
  "FOSSIL_SPECIMEN")

Observaciones:


c("OBSERVATION",
  "HUMAN_OBSERVATION",
  "MACHINE_OBSERVATION")

Examples

# Tabla usando todos los registros (sin filtrar por basisOfRecord)
if (FALSE) { # \dontrun{
extraer_resumen_taxonomico_gbif()
} # }

# Solo especimenes
if (FALSE) { # \dontrun{
extraer_resumen_taxonomico_gbif(
  basisOfRecord = c("PRESERVED_SPECIMEN",
                    "MATERIAL_SAMPLE",
                    "FOSSIL_SPECIMEN")
)
} # }

# Solo observaciones humanas
if (FALSE) { # \dontrun{
extraer_resumen_taxonomico_gbif(
  basisOfRecord = "HUMAN_OBSERVATION"
)
} # }